Theo cáo trạng, từ năm 2006 đến 2013, Nguyễn Huỳnh Đạt Nhân đã lập 7 doanh nghiệp đăng ký ngành nghề khác nhau và chỉ định nhân viên của mình đứng tên các công ty, doanh nghiệp và Nhân là người đứng ra chỉ đạo, thống nhất mọi hoạt động của các công ty này.
Mục đích lập ra nhiều công ty là để vay vốn ngân hàng rồi sử dụng số tiền vay sai mục đích, gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng, thiệt hại tài sản rất lớn cho Agribank Cần Thơ. Tính đến năm 2015, 7 công ty và cá nhân Đạt Nhân vay sử dụng trên 1.500 tỉ đồng. Nhiều khoản vay sau đó rơi vào nhóm nợ xấu, khó có thể thu hồi do các khoản vay chủ yếu để trả lãi, đảo nợ, đầu tư vào bất động sản, sử dụng cá nhân… Trong số này, Đạt Nhân đã mất khả năng thanh toán, gây thiệt hại cho Agribank Cần Thơ trên 303 tỉ đồng.
VKSND TP Cần Thơ chỉ ra rằng vì muốn đầu tư vào bất động sản nhưng không có vốn nên Đạt Nhân đã cùng với Hải, Liệu bàn bạc, thống nhất lợi dụng chính sách ưu đã lãi suất 0% trên gói vay của Chính phủ để lập hồ sơ khống, sai đối tượng nhằm vay vốn, trục lợi. Việc giải ngân của Agribank Cần Thơ sai hoàn toàn về trình tự thủ tục qui định của pháp luật và của ngành ngân hàng.
Cụ thể, chỉ với một tài sản là siêu thị Citimart vừa trúng đấu giá 104 tỉ đồng, chưa có giấy tờ hợp pháp nhưng Nhân đã bàn với Hải và Liệu để giải ngân nhiều lần với số tiền rất lớn.
Để toàn quyền sử dụng số tiền từ ngân hàng và che đậy, làm mất dấu dòng tiền, Nhân đã thuê nhân viên làm giám đốc, lập ra nhiều công ty và chỉ đạo cấp dưới làm tổng thầu cung cấp máy móc, thiết bị. Nhiều máy móc thiết bị, tài sản thế chấp ngân hàng đều được nâng khống giá trị lên gấp nhiều lần để được vay số tiền rất lớn.
Số tiền vay được từ gói vay hỗ trợ lãi suất 0%, Đạt Nhân đã dùng vào việc gửi tiết kiệm ngược lại cho Agribank Cần Thơ gần 150 tỉ đồng để lấy lãi gần 1 tỉ đồng, mua một miếng đất trên đường Nguyễn Trãi gần 60 tỉ đồng, chi xài cá nhân trên 21 tỉ đồng, trả nợ gốc và lãi cho các các khoản vay trên 92 tỉ đồng…
Trong gói vay hỗ trợ lãi suất, các cán bộ của Agribank Cần Thơ đã ký duyệt hỗ trợ lãi suất cho Đạt Nhân 49 lần với số tiền gần 62 tỉ đồng.
Khi bị công an phát hiện ra sai phạm, Đạt Nhân đã chỉ đạo cấp dưới lập ra nhiều chứng từ khống bổ sung, một mặt tiêu hủy tài liệu, vật chứng để đối phó cơ quan điều tra. Lúc bị công an bắt, Nhân còn cười tươi và xé biên bản làm việc.
Về phía Agribank Cần Thơ, sau khi làm việc với công an đã quyết định chuyển gói vay hỗ trợ lãi suất 0% sai quy định, sai đối tượng sang gói vay thương mại thông thường để khắc phục hậu quả. Đây được xem là "đại án" lớn nhất từ trước đến nay xảy ra ở TP Cần Thơ.
VKSND TP Cần Thơ khẳng định hành vi của các bị can trong vụ án này là nguy hiểm cho xã hội, gây thiệt hại về tài sản đặc biệt lớn cho Agribank, xâm phạm đến trật tự quản lý kinh tế của nhà nước… Chính vì vậy, VKS truy tố các bị can phạm tội "Vi phạm qui định về cho vay trong hoạt động của các tổ chức tín dụng", thuộc trường hợp gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng, với khung hình phạt tù lên đến 20 năm.